深圳大学 - 竞价公告 (CF105902024000142)

委托方（甲方）提供***例血液样本，由受托方（乙方）完成***例血标本的线粒体***（*****）甲基化检测，***例血标本的*****拷贝数检测及测序数据的数据整理及分析，技术内容如下： *.***提取、***浓度检测、***完整性检测和全血样本的保存； *.引物设计：对目标序列/位点进行靶向区域甲基化*****设计（****** ******** *****）,扩增子长度*般为***-*****长度范围； *.测序：测序策略为*****测序。拷贝数检测每个样本获得不少于*.*** *** ****数据(该数据量为***数据,在总数据量达标的情况下，每个样本数据量不低于目标数据量的**%，测序平均***≥**%，平均***≥**%)；甲基化检测平均深度****； *.线粒体***甲基化检测信息分析： *)去接头污染，去低质量*****和产量情况统计；*）*********信息采集序列与参考基因组目标序列的比对；*）*碱基深度和覆盖度分析；*）*碱基的甲基化水平统计；*）不同样本间基因甲基化水平比较； *.线粒体***拷贝数检测信息分析： *)原始数据质量评估；*）原始数据********；*）***** ***** 质量评估；*）参考基因组比对情况统计；*）拷贝数变异（***）分析；*）参考序列物种：**** *.技术要求： *）***提取、***浓度及完整性检测（硅胶层析柱法进行***提取；***** ***********检测***浓度；琼脂糖凝胶电泳法检测***完整性）；样本的保存：根据血样原有**号，对所提取的***进行编号，确保***编号与血样编号**对应。检测不合格的样品，需要保存在-**℃，保存好**号，做好记录，并在*个工作日内通知甲方，与甲方沟通存在的问题；*）*****甲基化检测：乙方对甲方确定的靶向区域进行基于****** ******** ****** *****系统的亚硫酸盐测序***引物设计，结合高通量测序进行检测，每个样本的位点/区域测序平均深度不低于****；*）*****拷贝数检测：每个样品进行质检及全基因组测序（***** ****** **********, ***）文库构建 对质检合格的样本基因组***进行***建库, 样本基因组经超声片段化，***片段主峰在***-*****范围，对应文库大小主峰在***-*****主峰范围。然后进行末端修复，接头连接，最后进行***扩增；*）乙方在甲方筛选确定的基因启动子区域进行***引物设计合成及验证

*. 甲方提供的样品不合格时，乙方应在*个工作日内与甲方进行沟通，甲方在*个工作日内进行样品的及时更换。 *. 如因乙方过错导致项目迟延时，乙方应及时与甲方沟通，乙方应承担违约责任，乙方除继续履行合同外，还应支付违约金，违约金为已支付金额的**%。 *. 乙方需对涉及本合同的技术文件、资料信息、检测结果等进行保密，保密期限为合同有效期及合同终止后*年内。泄密方承担因此给信息提供方造成的损失，并支付本项目总费用金额的**%作为违约金。 *. 如因乙方过错导致项目失败、合同被解除时，应当支付本项目总费用金额的 **% 作为违约金，还应在合同解除之日起**个日历日内返还甲方已经支付的合同款。